Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrc28Q3TX51 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc28Q3TX51 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms