Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Srsf6Q3TWW8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms