Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q3TTL0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3TTL0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms