Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam172aQ3TNH5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam172aQ3TNH5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms