Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc102aQ3TMW1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc102aQ3TMW1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms