Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp444Q3TDV8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp444Q3TDV8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp444Q3TDV8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp444Q3TDV8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp444Q3TDV8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp444Q3TDV8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp444Q3TDV8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp444Q3TDV8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp444Q3TDV8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zfp444Q3TDV8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zfp444Q3TDV8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zfp444Q3TDV8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp444Q3TDV8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp444Q3TDV8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms