Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc69Q3TCJ8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc69Q3TCJ8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms