Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem248Q3TBN1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms