Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hddc2Q3SXD3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms