Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpm1Q2TV84 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpm1Q2TV84 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms