Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chrna5Q2MKA5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna5Q2MKA5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms