Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1aQ2LKU9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms