Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Samd11Q1RNF8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd11Q1RNF8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd11Q1RNF8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd11Q1RNF8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd11Q1RNF8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd11Q1RNF8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd11Q1RNF8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd11Q1RNF8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd11Q1RNF8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd11Q1RNF8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd11Q1RNF8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Samd11Q1RNF8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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