Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sap25Q1EHW4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sap25Q1EHW4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms