Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cers3Q1A3B0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cers3Q1A3B0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms