Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpusd2Q149F1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Rpusd2Q149F1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Rpusd2Q149F1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Rpusd2Q149F1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Rpusd2Q149F1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Rpusd2Q149F1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Rpusd2Q149F1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Rpusd2Q149F1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd2Q149F1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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