Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim24Q0VG18 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms