Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkpd1Q0VF94 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkpd1Q0VF94 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkpd1Q0VF94 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkpd1Q0VF94 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkpd1Q0VF94 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkpd1Q0VF94 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkpd1Q0VF94 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkpd1Q0VF94 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkpd1Q0VF94 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkpd1Q0VF94 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms