Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc39dQ0VF76 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms