Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lmntd2Q0VET5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmntd2Q0VET5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms