Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rundc1Q0VDN7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rundc1Q0VDN7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms