Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb8Q0VBD0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms