Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps8Q0P5W1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps8Q0P5W1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms