Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc21bQ0HA38 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc21bQ0HA38 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc21bQ0HA38 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms