Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf541Q0GGX2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf541Q0GGX2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms