Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700061G19RikQ08EE8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700061G19RikQ08EE8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms