Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col17a1Q07563 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col17a1Q07563 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms