Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NrepQ07475 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
NrepQ07475 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms