Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn3Q07409 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms