Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Prrx2Q06348 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prrx2Q06348 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Prrx2Q06348 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Prrx2Q06348 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Prrx2Q06348 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Prrx2Q06348 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Prrx2Q06348 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prrx2Q06348 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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