Protein–RNA interactions for Protein: Q059Y8

Dcst1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcst1Q059Y8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dcst1Q059Y8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dcst1Q059Y8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dcst1Q059Y8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dcst1Q059Y8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dcst1Q059Y8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dcst1Q059Y8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dcst1Q059Y8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms