Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprgQ05909 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprgQ05909 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms