Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs3Q05895 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms