Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fmn1Q05860 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fmn1Q05860 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Fmn1Q05860 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms