Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hspg2Q05793 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hspg2Q05793 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hspg2Q05793 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hspg2Q05793 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Hspg2Q05793 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hspg2Q05793 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hspg2Q05793 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms