Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SryQ05738 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SryQ05738 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SryQ05738 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SryQ05738 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SryQ05738 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms