Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk18Q04899 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk18Q04899 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms