Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sox13Q04891 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sox13Q04891 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms