Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox8Q04886 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox8Q04886 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms