Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarcad1Q04692 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarcad1Q04692 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms