Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RelaQ04207 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RelaQ04207 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RelaQ04207 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RelaQ04207 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms