Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tff2Q03404 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tff2Q03404 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms