Protein–RNA interactions for Protein: Q03141

Mark3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark3Q03141 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mark3Q03141 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mark3Q03141 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms