Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nucb1Q02819 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nucb1Q02819 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms