Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NfiaQ02780 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NfiaQ02780 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms