Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjb4Q02738 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gjb4Q02738 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms