Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VcpQ01853 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms