Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mc1rQ01727 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms