Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EgfrQ01279 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EgfrQ01279 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms