Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HmgcrQ01237 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HmgcrQ01237 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms